Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpopQ6ZWS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpopQ6ZWS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms