Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efr3bQ6ZQ18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efr3bQ6ZQ18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efr3bQ6ZQ18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3bQ6ZQ18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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