Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssx9Q6XAS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssx9Q6XAS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssx9Q6XAS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms