Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc44a1Q6X893 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc44a1Q6X893 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc44a1Q6X893 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc44a1Q6X893 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slc44a1Q6X893 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc44a1Q6X893 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.4 ms