Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup98Q6PFD9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup98Q6PFD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup98Q6PFD9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup98Q6PFD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms