Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dtx4Q6PDK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dtx4Q6PDK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dtx4Q6PDK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dtx4Q6PDK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms