Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gapvd1Q6PAR5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gapvd1Q6PAR5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gapvd1Q6PAR5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gapvd1Q6PAR5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gapvd1Q6PAR5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms