Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcrQ6PAJ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcrQ6PAJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BcrQ6PAJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms