Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Trak2Q6P9N8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak2Q6P9N8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak2Q6P9N8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak2Q6P9N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms