Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Caskin1Q6P9K8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Caskin1Q6P9K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Caskin1Q6P9K8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Caskin1Q6P9K8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Caskin1Q6P9K8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Caskin1Q6P9K8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms