Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC061212Q6P8K3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC061212Q6P8K3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms