Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msantd2Q6NZR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msantd2Q6NZR2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msantd2Q6NZR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msantd2Q6NZR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms