Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Pprc1Q6NZN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Pprc1Q6NZN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pprc1Q6NZN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms