Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpdc1Q6NZK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms