Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rprd2Q6NXI6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rprd2Q6NXI6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rprd2Q6NXI6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rprd2Q6NXI6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms