Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frem2Q6NVD0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frem2Q6NVD0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frem2Q6NVD0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frem2Q6NVD0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms