Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NipblQ6KCD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NipblQ6KCD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms