Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm4Q6IRU2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm4Q6IRU2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm4Q6IRU2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms