Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf6Q6IR41 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1qtnf6Q6IR41 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf6Q6IR41 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms