Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Best3Q6H1V1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Best3Q6H1V1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Best3Q6H1V1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Best3Q6H1V1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Best3Q6H1V1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms