Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam196bQ6GQV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam196bQ6GQV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam196bQ6GQV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam196bQ6GQV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms