Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg9bQ6EBV9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9bQ6EBV9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg9bQ6EBV9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg9bQ6EBV9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms