Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Smarca2Q6DIC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Smarca2Q6DIC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Smarca2Q6DIC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Smarca2Q6DIC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms