Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms