Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms