Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc2Q69ZB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc2Q69ZB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms