Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn4Q69Z26 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntn4Q69Z26 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms