Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sptbn2Q68FG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sptbn2Q68FG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sptbn2Q68FG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms