Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q66JV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q66JV7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q66JV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q66JV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q66JV7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q66JV7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q66JV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q66JV7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q66JV7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q66JV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q66JV7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q66JV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q66JV7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q66JV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q66JV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q66JV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q66JV7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q66JV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q66JV7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q66JV7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q66JV7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q66JV7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q66JV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q66JV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q66JV7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q66JV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q66JV7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q66JV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q66JV7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q66JV7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q66JV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q66JV7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q66JV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q66JV7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q66JV7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q66JV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q66JV7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q66JV7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q66JV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q66JV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q66JV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q66JV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q66JV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q66JV7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q66JV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q66JV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q66JV7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q66JV7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q66JV7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q66JV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q66JV7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q66JV7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms