Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VclQ64727 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VclQ64727 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VclQ64727 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VclQ64727 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VclQ64727 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VclQ64727 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VclQ64727 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VclQ64727 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VclQ64727 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VclQ64727 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VclQ64727 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VclQ64727 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VclQ64727 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VclQ64727 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VclQ64727 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VclQ64727 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VclQ64727 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VclQ64727 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VclQ64727 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VclQ64727 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VclQ64727 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VclQ64727 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VclQ64727 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VclQ64727 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VclQ64727 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VclQ64727 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VclQ64727 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VclQ64727 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VclQ64727 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VclQ64727 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VclQ64727 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VclQ64727 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VclQ64727 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VclQ64727 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VclQ64727 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VclQ64727 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VclQ64727 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VclQ64727 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VclQ64727 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VclQ64727 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VclQ64727 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VclQ64727 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VclQ64727 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VclQ64727 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VclQ64727 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VclQ64727 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VclQ64727 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms