Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd33Q63994 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd33Q63994 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd33Q63994 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd33Q63994 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd33Q63994 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms