Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sp4Q62445 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sp4Q62445 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp4Q62445 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp4Q62445 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms