Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TrhQ62361 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TrhQ62361 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TrhQ62361 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TrhQ62361 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TrhQ62361 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TrhQ62361 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TrhQ62361 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TrhQ62361 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TrhQ62361 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TrhQ62361 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TrhQ62361 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TrhQ62361 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrhQ62361 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TrhQ62361 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TrhQ62361 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrhQ62361 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TrhQ62361 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TrhQ62361 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrhQ62361 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrhQ62361 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrhQ62361 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrhQ62361 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms