Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc2Q62029 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc2Q62029 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc2Q62029 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms