Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf1Q61999 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms