Protein–RNA interactions for Protein: Q61333

Tnfaip2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip2Q61333 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip2Q61333 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfaip2Q61333 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip2Q61333 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip2Q61333 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.1 ms