Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc9a1Q61165 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a1Q61165 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc9a1Q61165 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc9a1Q61165 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms