Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf235Q61116 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf235Q61116 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf235Q61116 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms