Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Meis1Q60954 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis1Q60954 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis1Q60954 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Meis1Q60954 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms