Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d1Q60949 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d1Q60949 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d1Q60949 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d1Q60949 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms