Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik1Q60934 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik1Q60934 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms