Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmelQ60696 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmelQ60696 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmelQ60696 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmelQ60696 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmelQ60696 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmelQ60696 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PmelQ60696 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PmelQ60696 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PmelQ60696 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PmelQ60696 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PmelQ60696 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms