Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Scaf1Q5U4C3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Scaf1Q5U4C3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Scaf1Q5U4C3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Scaf1Q5U4C3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms