Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc11Q5U458 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc11Q5U458 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc11Q5U458 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms