Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mfsd3Q5U419 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd3Q5U419 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mfsd3Q5U419 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd3Q5U419 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd3Q5U419 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd3Q5U419 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd3Q5U419 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms