Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NotoQ5TIS6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NotoQ5TIS6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NotoQ5TIS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms