Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim38Q5SZ99 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim38Q5SZ99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim38Q5SZ99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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