Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctc1Q5SUQ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctc1Q5SUQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms