Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930512M02RikQ5SQK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930512M02RikQ5SQK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms