Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps54Q5SPW0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps54Q5SPW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms